《彗星路西法》講述閃耀著藍(lán)色光輝的礦石吉夫特礦石所覆蓋的大地，行星吉夫特。宗吾天城是住在因吉夫特礦石采掘而繁榮的小鎮(zhèn)，靛藍(lán)花園的純樸少年。以收集稀少礦石為樂趣的宗吾，某天被卷入同級(jí)生卡恩、羅曼、歐特等人引發(fā)的騷動(dòng)，迷失在礦山深處的地底湖。在那里，宗吾遇到了一位不可思議的少女隨風(fēng)飄逸的藍(lán)色長發(fā)，直直凝視的紅色瞳孔。她究竟是什么人，這次邂逅給宗吾帶來了什么？隨后，締結(jié)的羈絆將打開通往冒險(xiǎn)的大門。